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根据上述职责，市农林局设3个职能处室、5个事业站。
一、办公室
组织、协调机关政务工作；负责局的文秘、档案、会议、政务信息、督查、信访、保密等工作；组织有关综合性材料、文件的起草；制订局机关内部规章制度并组织实施；负责局机关的基建、房产和保卫等事务；负责局机关财务工作及指导下属单位的财务管理；负责局机关及直属单位的组织、人事、培训教育及离退休人员管理等工作；配合有关部门搞全市农林业系列专业技术职务推荐、评审工作；协助有关部门做好农民技术职称评定工作；负责和指导农林业科技成果管理，农林业教育培训和农林业科技宣传工作；参与农业扶贫工作；负责抗灾救灾农用物资的分配工作；做好财务管理工作。
二、政策法规处
参与研究制订农林业及有关农村经济发展的规划、措施和重大经济政策；引导农林业产业结构的合理调整、资源的合理配置和产品品质的改善；参与研究提出深化农村经济体制改革的意见。负责全市植物检疫、农药、种子、种苗、蚕种、食（药）用菌种管理，蔬菜基地建设保护、农业技术推广等农业行政执法工作，受理违反农林业法律、法规和规章行为的举报，组织开展农林业执法检查，查处重大农业违法案件。负责农林业法制宣传教育，组织执法人员培训。审核以局名义作出的农业行政许可、行政处罚等具体行政行为。负责农林业执法监督、行政诉讼、行政复议和错案追究工作。
三、产业信息处
负责制订农林业产业化经营的有关政策，组织全市农业项目的申报、验收；积极开展农业招商引资活动；指导农业产业化经营、现代农业示范园区、农业标准化推广等工作；指导全市农林业信息体系建设。
四、农业推广中心站
贯彻执行《农业技术推广法》，制定种植业发展规划，良种、良法试验、示范和推广，农作物品种审定，病虫测报，土壤肥力监测，农业技术培训，全市农用生产资料年度计划。蔬菜新品种、新技术的试验示范和推广，名特优等有关农产品生产的技术培训和咨询、制订发展蔬菜生产基地的规划和布局，无公害农产品检测。
五、林业工作站（绿化办、森林公安）
制订全市绿化规划，组织全民义务植树活动，指导全市营造林工作；组织开展森林资源调查，编制全市森林采伐限额计划，监督管理木材采伐、加工、运输；监督管理林木种籽、种苗生产经营活动；主管陆生野生动、植物和林地资源保护管理；负责全市森林防火和森林病虫害防治、检疫工作。
六、畜牧兽医站
负责制定全市畜牧生产发展规划，推进畜牧产业化进程及推广应用畜牧先进生产技术，宣传贯彻执行有关动物防疫、种畜禽、兽药、饲料及饲料添加剂管理等法律、法规；负责全市动物防疫监督、实施无公害畜产品工程。
七、农机管理站
负责全市农业机械使用管理、农用柴油供应、农机抗灾救灾、农机维修管理、农机化统计；全市农机化服务体系建设；全市农机化新机具和新技术的引进、示范和推广及项目的立项、论证和实施；全市拖拉机等农业机械安全监理（安全技术检验、注册、发放牌证及农机驾驶操作人员考试、考核发证）；全市农业机械驾驶操作人员的教育培训及管理工作。
八、农经站
负责稳定和完善农村基本经营制度、政策；指导、管理农村土地承包及经营权证工作；指导、监督农村集体资产管理、财务审计和经济分析统计工作；负责农民负担的监督管理工作；指导农村专业合作经济组织建设；指导、监督乡镇政务公开工作。
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